Adhérence : capacité de se fixer à une surface tissulaire ou bactérienne, mettant en jeu des forces faibles ou fortes, le plus souvent spécifiques, ce qui distingue ce phénomène de la simple rétention.
Aérobie : se dit d’une bactérie qui ne peut se multiplier qu’en présence d’oxygène. Les bactéries aérobies ont un système d’oxydo-réduction où l’oxygène moléculaire est le seul accepteur d’électrons possible (respiration).
Aérobiose : condition de culture propice au développement des bactéries aérobies ; l’atmosphère contient de l’oxygène.
Anaérobie : se dit d’une bactérie qui ne tolère pas ou peu l’oxygène. Les bactéries anaérobies ne possèdent pas les enzymes nécessaires pour utiliser l’oxygène comme accepteur d’électrons ; leur métabolisme est fermentatif. L’accepteur d’électrons (ou de portons) est souvent une substance organique qu’elle produit.
Anaérobiose : condition de culture indispensable au développement des bactéries anaérobies : l’atmosphère est dépourvue d’oxygène : en général, elle est composée d’un mélange gazeux d’azote d’hydrogène et de gaz carbonique, dans les proportions 80 : 10 : 10.
Bactérie : protiste procaryote muni d ‘un cytoplasme, d’un seul chromosome à ADN, sans membrane nucléaire.
Cellule : unité de matière vivante capable de fonctionner en indépendance. C’est l’unité fondamentale et de fonction du vivant. La cellule est l’élément primordial des niveaux d’organisation de la matière vivante qui permet aux atomes et molécules de s’organiser et tissus et être multicellulaires. Une bactérie est une cellule.
Commensalisme : type de relation entre organismes dans laquelle un organisme tire profit de l’association alors que l’autre reste indiffèrent.
Entérobactéries : bacilles à Gram negatif, vivant dans le tube digestif, appartenant à la famille des Enterobacteriaceae, qui regroupe de nombreux genres Ex : Escherichia, Klebsiella, Salmonella, Shigella.
Entérocoques : streptocoques hôtes du tube digestif, Ex : Enteroccus faecalis.
Facultative ou anaérobie facultative : se dit d’une bactérie anaérobie possédant l’équipement enzymatique des aérobies et certaines enzymes lui permettant d’utiliser l’oxygène à l’état combiné comme accepteur d’électrons.
Micro-organisme :organisme de taille microscopique, c’est-à-dire qui ne peut s’observer qu’à l’aide d’un microscope. Synonymes : microbe, germe. Les micro-organismes sont classés en quatre grands groupes biologiques : protozoaires, mycètes, bactéries et virus.
Rétention : fait de retenir dans un espace ou un matériau, ne mettant pas en jeu des forces d’adhérence.
Systémique (maladie) : terme récent, d’origine anglo-américaine, désignant une maladie affectant l’économie générale et non un système particulier(par exemple pulmonaire ou digestif) ; à proprement parler, il faudrait dire maladie du système général.
Virus : particule infectieuse intracellulaire obligatoire, possédant de l’ADN ou de l’ARN, mais jamais les deux ensemble.
Notions de taxonomie bactrienne : la taxonomie, ou taxinomie, du grec taxis, arrangement, et la science des lois de la classification des formes vivantes. Elle permet de réunir les bactéries en groupes apparentés ou taxons, en faisant appel à trois sources d’information complémentaires : l’identification qui analyse les caractères propres à chaque isolat ; la classification qui définit les relations entre micro-organismes en fonction de leurs caractères ; la nomenclature qui attribue un nom aux isolats et aux taxons d’après un code international de nomenclature.